Nghiên Cứu Làm Sáng Tỏ Hệ Vi Sinh Vật Của Cá Nuôi

Mọi chuyện bắt đầu với việc các nhà khoa học tại Nofima tiến hành một cuộc thử nghiệm trong đó họ cho cá hồi nuôi trong một khoảng thời gian và đo các thông số như sử dụng thức ăn, tốc độ tăng trưởng và cấu trúc vi khuẩn trong ruột, sử dụng phương pháp giải trình tự DNA tiêu chuẩn của ngành.

Tuy nhiên, các nhà khoa học trở nên nghi ngờ về vi khuẩn mà họ tìm thấy trong ruột cá hồi. Các cuộc điều tra sâu hơn cho thấy rằng phương pháp giải trình tự DNA mà họ đã sử dụng có những hạn chế của nó.

Tóm lại, những gì họ phát hiện ra là các phân tích được tiến hành từ DNA đã được giải trình tự của hệ vi khuẩn đường ruột không tính đến việc vi sinh vật được tìm thấy trong ruột có thể là vi khuẩn chết từ thức ăn cho cá.

Theo nhà khoa học sức khỏe cá Christian Karlsen và nhà khoa học vi khuẩn Ida Rud tại Nofima, vấn đề là không phổ biến ở Na Uy hay quốc tế - để phân tích thức ăn khi nghiên cứu hệ vi khuẩn đường ruột ở cá.

Nghiên cứu của Karlsen và Rud, kiểm tra 15 nguồn cấp dữ liệu trong 5 nghiên cứu khác nhau, gần đây đã được công bố trên tạp chí Nature, với tiêu đề: “Hệ vi sinh vật trong thức ăn: yếu tố gây nhiễu ảnh hưởng đến các nghiên cứu về hệ vi sinh vật đường ruột cá”.

Karlsen nói trong một thông cáo báo chí: “Phương pháp, là một dạng giải trình tự sâu, cung cấp nhiều khả năng và có thể xác định hàng nghìn vi khuẩn trong một mẫu, nhưng người ta phải nhận thức được những hạn chế của nó.

“Có thể đã có giả thiết cho rằng ruột cá tương tự như ruột của các động vật khác, chúng có một cộng đồng vi sinh vật phức tạp trong ruột. Do đó, người ta có thể không nghĩ rằng một vài vi khuẩn đi kèm với thức ăn lại đóng một vai trò quan trọng”, ông nói thêm.

Ruột cá dường như có một cộng đồng vi sinh vật tương đối đơn giản, nơi chỉ có một vài nhóm vi khuẩn chiếm ưu thế. Tuy nhiên, nguyên liệu thô trong thức ăn cho cá chứa nhiều chất dinh dưỡng mà các loại vi sinh vật khác nhau có thể sử dụng. Ngay cả khi những vi khuẩn này chết trong quá trình chế biến, DNA của chúng vẫn có thể được thức ăn đưa vào ruột cá. Ví dụ, vi khuẩn axit lactic, thường được kết hợp với các nguyên liệu có nguồn gốc thực vật.

Rud nói: “Nguyên liệu thô trong thức ăn cho cá là thức ăn nhẹ cho vi khuẩn.

Cô tin rằng những bất cập của nhiều nghiên cứu có thể là do thái độ rất lạc quan đối với phương pháp giải trình tự DNA khi nó ra đời.

Rud giải thích: “Chúng ta không được chuyển giao bừa bãi các phương pháp luận và diễn giải từ các nghiên cứu trên người và chuột sang cá. Cô tin rằng các nhà khoa học vẫn còn biết rất ít về đời sống của vi sinh vật trong ruột cá.

Karlsen và Rud nói rằng những phát hiện này có tầm quan trọng lớn đối với việc nghiên cứu thức ăn thủy sản.

Tới lúc thay đổi

Theo các nhà khoa học, bất kỳ ai có ý định thực hiện các nghiên cứu thức ăn chăn nuôi trong đó lập bản đồ của hệ vi khuẩn đường ruột hiện phải thực hiện các nghiên cứu theo cách khác.

“Kể từ bây giờ, chúng tôi kiểm tra trình tự DNA từ ruột liên quan đến thức ăn chăn nuôi đã được sử dụng, hoặc trình tự RNA vi sinh vật để xác định các vi sinh vật hoạt động. Chúng tôi cũng có thể kết hợp nó với việc nuôi cấy tế bào để phân lập những vi khuẩn này”, Rud đề xuất.

Karlsen và Rud tin rằng còn một chặng đường dài trước khi chúng ta hiểu đầy đủ về vai trò của vi khuẩn đường ruột đối với quá trình tiêu hóa thức ăn và tác động sâu hơn của chúng đối với sức khỏe cá.