Tiểu Phần Nhỏ ở Nhân Thực (40S) – Wikipedia Tiếng Việt

Bước tới nội dung

Nội dung

chuyển sang thanh bên ẩn

• Đầu
• 1 Chức năng
• 2 Cấu trúc chung
• 3 Proteins ribosome của tiểu phần 40S
• 4 Chú thích

• Bài viết
• Thảo luận

Tiếng Việt

• Đọc
• Sửa đổi
• Sửa mã nguồn
• Xem lịch sử

Công cụ Công cụ chuyển sang thanh bên ẩn Tác vụ

• Đọc
• Sửa đổi
• Sửa mã nguồn
• Xem lịch sử

Chung

• Các liên kết đến đây
• Thay đổi liên quan
• Liên kết thường trực
• Thông tin trang
• Trích dẫn trang này
• Tạo URL rút gọn
• Tải mã QR

In và xuất

• Tạo một quyển sách
• Tải dưới dạng PDF
• Bản để in ra

Tại dự án khác

• Khoản mục Wikidata

Giao diện chuyển sang thanh bên ẩn Bách khoa toàn thư mở Wikipedia

Tiểu phần nhỏ của ribosome (40S) là tiểu đơn vị nhỏ hơn của ribosome 80S ở sinh vật nhân chuẩn, khác với một tiểu đơn vị khác là tiểu phần ribosome lớn (60S). Tên "40S" và "60S" bắt nguồn từ quy ước rằng các hạt ribosome được biểu thị theo hệ số lắng đọng của chúng trong đơn vị Svedberg. Tiểu phần này có cấu trúc và chức năng liên quan đến tiểu đơn vị 30S của ribosome 70S của sinh vật nhân sơ..[1][2][3][4][5] Tuy nhiên, tiểu đơn vị 40S là lớn hơn nhiều so với tiểu đơn vị 30S ở bọn nhân sơ và chứa nhiều phân đoạn protein bổ sung, cũng như các phân đoạn mở rộng rRNA.

Chức năng

[sửa | sửa mã nguồn]

Tiểu đơn vị 40S chứa trung tâm dịch mã có nhiệm vụ theo dõi sự khớp bổ sung của tRNA và mRNA trong sản phẩm dịch protein. Nó là thành phần lớn nhất của một số phức hợp dịch khởi đầu, bao gồm các phức hợp tiền xử lý 43S và 48S (PIC), liên kết với một số yếu tố khởi đầu nhân chuẩn, bao gồm eIF1, eIF1A và eIF3.[6] Tiểu đơn vị 40S cũng liên kết chặt chẽ bởi HCV IRES để tạo thành một phức hệ hai phần với trung gian nhờ các tương tác protein-mRNA và rRNA-mRNA.[7] Có thể tìm thấy thêm thông tin trong các bài về ribosome, ribosome nhân chuẩn (80S) và bài viết về dịch mã protein.

Cấu trúc chung

[sửa | sửa mã nguồn]

Hình dạng của tiểu phần nhỏ có thể được chia thành hai phần lớn, đầu và thân. Đặc trưng của phần thân bao gồm bàn chân trái và phải, vai và nền. Phần đầu có một khối nhô ra, nhọn có thể liên tưởng đến mỏ của một con chim. mRNA liên kết trong khe hở giữa đầu và cơ thể, và có ba vị trí liên kết cho tRNA, là miền A, miền P và miền E (xem bài viết về dịch mã protein để biết chi tiết). Lõi của tiểu đơn vị 40S được hình thành bởi RNA ribosome 18S (viết tắt là 18S rRNA), tương đồng với rRNA 16S ở sinh vật nhân sơ. Lõi rRNA này được đi kèm với hàng chục protein. Trong hình "Cấu trúc tinh thể của tiểu đơn vị ribosome 40S ở nhân thực: T. thermophila", lõi RNA ribosome được biểu diễn là ống với màu xám và các đoạn mở rộng được thể hiện bằng màu đỏ. Protein mà tương đồng ở sinh vật nhân chuẩn, vi sinh vật cổ và vi khuẩn được thể hiện với màu xanh. Protein chỉ tương đồng giữa các sinh vật nhân chuẩn và vi sinh vật cổ được thể hiện bằng màu cam và các protein đặc trưng cho sinh vật nhân chuẩn được thể hiện bằng màu đỏ.

Cấu trúc tinh thể của tiểu phần 40S từ sinh vật nhân thực: T. thermophila

• Tiểu phần 40S nhìn từ mặt trong, PDB chỉ ra 2XZM
• Tiểu phần 40S nhìn từ mặt tiếp xúc với môi trường, PDB chỉ ra 2XZM

Proteins ribosome của tiểu phần 40S

[sửa | sửa mã nguồn]

Bảng "Protein ribosome 40S" cho thấy các nếp gấp protein riêng lẻ của tiểu đơn vị 40S, mã màu vẫn giữ nguyên như trên. Protein có tương đồng trong sinh vật nhân chuẩn, vi sinh vật cổ và vi khuẩn (EAB) thể hiện bằng màu xanh. Protein chỉ tương đồng giữa các sinh vật nhân chuẩn và sinh vật cổ (EA) thể hiện bằng màu cam và protein đặc hiệu cho sinh vật nhân chuẩn (E) được thể hiện bằng dải băng màu đỏ. Các phần mở rộng cụ thể của các protein được bảo tồn của nhân thực, từ một vài chuỗi bên hoặc vòng lặp đến các xoắn alpha rất dài và các miền bổ sung, được đánh dấu màu đỏ. Để biết chi tiết, hãy tham khảo bài viết về ribosome nhân chuẩn. Trong lịch sử, nhiều thuật ngữ khác nhau đã được sử dụng cho các protein ribosome. Ví dụ, các protein đã được đánh số theo tính chất di chuyển của chúng trong các thí nghiệm điện di gel. Do đó, các tên gọi khác nhau có thể chỉ các protein giống nhau từ các sinh vật khác nhau, trong khi các tên giống hệt nhau không nhất thiết biểu thị các protein tương đồng. Bảng "40S protein ribosomal" liên kết chéo các tên protein ribosome của con người với nấm men, vi khuẩn và tương đồng vi sinh vật cổ. Thông tin thêm có thể được tìm thấy trong cơ sở dữ liệu gen protein ribosome (RPG).[8]

Cấu trúc (Nhân thực)	H. sapiens[8][9]	Bảo thủ[10]	S. cerevisiae[11]	Tương đồng vi khuẩn(E. coli)	Tương đồng vi sinh vật cổ
	RPSA	EAB	S0	S2p	S2
	RPS2	EAB	S2	S5p	S5p
	RPS3	EAB	S3	S3p	S3p
	RPS3A	EA	S1	n/a	S3Ae
	RPS4 (RPS4X, RPS4Y1, RPS4Y2)	EA	S4	n/a	S4e
	RPS5	EAB	S5	S7p	S5p
	RPS6	EA	S6	n/a	S6e
	RPS7	E	S7	n/a	n/a
	RPS8	EA	S8	n/a	S8e
	RPS9	EAB	S9	S4p	S4p
	RPS10	E	S10	n/a	n/a
	RPS11	EAB	S11	S17p	S17p
	RPS12	E	S12	n/a	n/a
	RPS13	EAB	S13	S15p	S15p
	RPS14	EAB	S14	S11p	S11p
	RPS15	EAB	S15	S19p	S19p
	RPS15A	EAB	S22	S8p	S8p
	RPS16	EAB	S16	S9p	S9p
	RPS17	EA	S17	n/a	S17e
	RPS18	EAB	S18	S13p	S13p
	RPS19	EA	S19	n/a	S19e
	RPS20	EAB	S20	S10p	S10p
	RPS21	E	S21	n/a	n/a
	RPS23	EAB	S23	S12p	S12p
	RPS24	EA	S24	n/a	S24e
	RPS25	EA	S25	n/a	S25e
	RPS26	EA	S26	n/a	S26e
	RPS27	EA	S27	n/a	S27e
	RPS27A	EA	S31	n/a	S27ae
	RPS28	EA	S28	n/a	S28e
	RPS29	EAB	S29	S14p	S14p
	RPS30	EA	S30	n/a	S30e
	RACK1	E	Asc1	n/a	n/a

x t s Tổng hợp protein: Dịch mã (Vi khuẩn, Vi sinh vật cổ, Nhân thực)
Protein	Yếu tố mở đầu Vi khuẩn PIF-1 PIF-2 PIF-3 Vi sinh vật cổ aIF1 aIF2 aIF5 aIF6 Nhân thực eIF1 eIF1 EIF1AX AY 1B eIF2 EIF2S1 EIF2S2 EIF2S3 EIF2B1 EIF2B2 EIF2B3 EIF2B4 EIF2B5 EIF-2 kinase eIF2A eIF2D eIF3 EIF3A B C D E F G H I J K L M eIF4 EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H eIF5 EIF5 EIF5A A2 5B eIF6 EIF6 Yếu tố kéo dài Vi khuẩn EF-Tu EF-Ts EF-G Vi sinh vật cổ aEF-1 aEF-2 Nhân thực EEF-1 EEF1A1 EEF1A2 EEF1A3 EEF1B1 EEF1B2 EEF1B3 EEF1B4 EEF1D EEF1E1 EEF1G EEF2 Yếu tố giải phóng Vi khuẩn Vi sinh vật cổ Nhân thực (ETF1) Protein của ribosome Bào tương Tiểu phần 60S RPL3 RPL4 RPL5 RPL6 RPL7 RPL7A RPL8 RPL9 RPL10 RPL10A RPL10-like RPL11 RPL12 RPL13 RPL13A RPL14 RPL15 RPL17 RPL18 RPL18A RPL19 RPL21 RPL22 RPL23 RPL23A RPL24 RPL26 RPL27 RPL27A RPL28 RPL29 RPL30 RPL31 RPL32 RPL34 RPL35 RPL35A RPL36 RPL36A RPL37 RPL37A RPL38 RPL39 RPL40 RPL41 RPLP0 RPLP1 RPLP2 RRP15-like RSL24D1 Tiểu phần 40S RPSA RPS2 RPS3 RPS3A RPS4 (RPS4X, RPS4Y1, RPS4Y2) RPS5 RPS6 RPS7 RPS8 RPS9 RPS10 RPS11 RPS12 RPS13 RPS14 RPS15 RPS15A RPS16 RPS17 RPS18 RPS19 RPS20 RPS21 RPS23 RPS24 RPS25 RPS26 RPS27 RPS27A RPS28 RPS29 RPS30 RACK1 Ty thể Tiểu phần 39S MRPL1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 Tiểu phần 28S MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35
Other concepts	Aminoacyl tRNA synthetase Reading frame Start codon Stop codon Trình tự Shine-Dalgarno/Trình tự Kozak

Chú thích

[sửa | sửa mã nguồn]

1. ^ MeSH 40S+Ribosomal+Subunits
2. ^ Rabl, J; Leibundgut, M; Ataide, SF; Haag, A; Ban, N (tháng 2 năm 2011). "Crystal structure of the eukaryotic 40S ribosomal subunit in complex with initiation factor 1". Science. Quyển 331 số 6018. tr. 730–6. doi:10.1126/science.1198308. PMID 21205638.
3. ^ Ben-Shem, A; Garreau; de Loubresse, N; Melnikov, S; Jenner, L; Yusupova, G; Yusupov, M (tháng 12 năm 2011). "The structure of the eukaryotic ribosome at 3.0 Å resolution". Science. Quyển 334 số 6062. tr. 1524–9. doi:10.1126/science.1212642. PMID 22096102.
4. ^ Wimberly, BT; Brodersen, DE; Clemons, WM Jr; Morgan-Warren, RJ; Carter, AP; Vonrhein, C; Hartsch, T; Ramakrishnan, V (tháng 9 năm 2000). "Structure of the 30S ribosomal subunit". Nature. Quyển 407 số 6802. tr. 327–39. doi:10.1038/35030006. PMID 11014182.
5. ^ Schmeing, TM; Ramakrishnan, V (tháng 10 năm 2009). "What recent ribosome structures have revealed about the mechanism of translation". Nature. Quyển 461 số 7268. tr. 1234–42. doi:10.1038/nature08403. PMID 19838167.
6. ^ Aitken, Colin E.; Lorsch, Jon R. (2012). "A mechanistic overview of translation initiation in eukaryotes". Nat. Struct. Mol. Biol. Quyển 19 số 6. tr. 568–576. doi:10.1038/nsmb.2303. PMID 22664984. Truy cập ngày 20 tháng 2 năm 2016.
7. ^ Lytle JR, Wu L, Robertson HD (tháng 8 năm 2002). "Domains on the hepatitis C virus internal ribosome entry site for 40s subunit binding". RNA. Quyển 8 số 8. tr. 1045–55. doi:10.1017/S1355838202029965. PMC 1370315. PMID 12212848.
8. ^ a b Nakao, A; Yoshihama, M; Kenmochi, N (2004). "RPG: the Ribosomal Protein Gene database". Nucleic Acids Res. Quyển 32 số Database issue. tr. D168–70. doi:10.1093/nar/gkh004. PMC 308739. PMID 14681386.
9. ^ Nomenclature according to the ribosomal protein gene database, applies to H. sapiens and T. thermophila
10. ^ EAB means conserved in eukaryotes, archaea and bacteria, EA means conserved in eukaryotes and archaea and E means eukaryote-specific protein
11. ^ Traditionally, ribosomal proteins were named according to their apparent molecular weight in gel electrophoresis, leading to different names for homologous proteins from different organisms. The RPG offers a unified nomenclature for ribosomal protein genes based on homology.

Lấy từ “https://vi.wikipedia.org/w/index.php?title=Tiểu_phần_nhỏ_ở_nhân_thực_(40S)&oldid=74382247” Thể loại:

• Sinh học tế bào

Tìm kiếm Tìm kiếm Đóng mở mục lục Tiểu phần nhỏ ở nhân thực (40S) 5 ngôn ngữ Thêm đề tài